記者周佩虹／台北報導
就在行政院宣布秘書長林益世請辭獲准後，總統府也在11點50分左右發布新聞稿表示，馬英九總統知道這件事，尊重林秘書長的選擇，同意他辭職，同時也感謝林秘書長多年來對行政及立法團隊的付出與協助。
李佳霏表示，全案已進入司法程序，總統府尊重司法調查，支持司法單位勿枉勿縱。李佳霏重申，馬總統認為，清廉是公務員最基本的道德標準，不容許有灰色地帶。
行政院是在上午11點左右發布新聞表示，行政院長陳冲已經同意行政院秘書長林益世請辭。新聞稿中指出，陳院長曾於昨日深夜與林益世秘書長懇談，林益世當時即表示這兩天媒體的報導，已對行政院及行政團隊帶來困擾內心極感不安；林秘書長強調他的清白、絕對沒有收賄，但他不願意造成行政團隊任何困擾。
另一方面，林益世也需要時間查證蒐集資料並配合司法程序調查，所以他昨天深夜向陳院長口頭請辭明志，今天早上補提書面辭呈，以便有充裕時間配合檢調單位調查，捍衛清白。
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而陳冲則表示，考量林秘書長目前確實需要更多時間配合特偵組調查，因此尊重其選擇，同意他的辭呈。希望林秘書長儘速蒐集人、事、物等資料，對外釐清疑點。陳院長指出，目前本案已進入司法程序，行政團隊的穩定運作不會受到影響。